kolokium oh kolokium..

Daftar topik yang harus dipelajari untuk persiapan kolokium 29 mei 2013.. GANBATTEEEEE !!!

1.       Bagaimana morfologi daun kelor, gambarkan dan jelaskan?

2.       Penyakit apa saja yang bisa disebabkan oleh bakteri Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Enterobacter aerogenes, dan Pseudomonas aeruginosa

3.       Maksud dari “zat penghambat jasad renik” itu bgmna?

4.       Maksud dari pernyataan berikut “Saponin bekerja dengan merusak membran sitoplasma yang kemungkinan saponin mempunyai efek yang sinergis atau adiktif dengan golongan polifenol dalam merusak permeabilitas sel bakteri itu sendiri.”

5.       Perbedaan pengaruh pemberian ekstrak daun kelor terhadap bakteri gram negatif dan positif itu apa? Apa yang terjadi pada dinding selnya? Bagaimana mekanisme penghambatannya?

6.       Bagaimana struktur dinding bakteri dari gram positif dan gram negatif? Dan bagaimana resistensinya?

7.       Semakin besar zona hambat, maka apa? Dan bagaimana?

8.       Gambar mekanisme bahan aktif antibakteri seperti flavonoid, saponin, tanin, dan senyawa fenolik lain sebagai antibakteri.

9.       Kalo permeabilitas dinding sel bakteri itu meningkat, efeknya apa dan bagaimana?

10.   Telaah baik2 setiap kalimat pada paragraf ini, ntar ditanya pak didi lho.

“Membran sel ini dapat melindungi bakteri Gram negatif dari substansi antipeptidoglikan seperti penisilin. Ikatan antar asam amino dalam peptidoglikan bakteri Gram negatif lebih renggang dibandingkan dengan bakteri Gram positif (McKane dan Kandel dikutip Dhayanti, 2010:5), sehingga memudahkan senyawa minyak atsiri, polifenol, dan saponin untuk masuk kedalam ikatan. Selain itu, dinding selnya tidak selektif permeabel, sehingga senyawa-senyawa tersebut mudah dalam penetrasi menembus dinding sel yang akan menimbulkan tergangunya integritas dinding sel bakteri.”

11.    

Curcol dikit:

Setelah me review dan membaca ulang makalah kolokium dengan cermat, ternyata banyak banget typo, n banyak banget yang aku tidak mengerti, dan banyak banget yang harus dipelajari jauh lebih dalam. Mau ngeprint ulang ga ada tinta, kasian banget ya aku,, ksian ksian ksian..

Setelah dikumpulkan daftar pertanyaan yang aku perlu pelajari ulang, ternyata aku yang dari awal udah ngebahas ini aja punya segudang pertanyaan dari bahasanku, gimana orang lain yang bakal jadi peserta seminar. Waduh, sampe sini aku jadi makin galau. Kalo udah galau gini biasanya aku memilih tidur dan mengubur semua ingatan2 tentang kolokium sedalam mungkin. Tapi malangnya, ingatan kolokium yang aku bawa tidur itu hadir dalam bentuk bad dream dan buat parno setengah mati, lebay ya aku, ya emang gitu kenyataannya. Oleh karena itu, kali ini aku memilih menceritakan kegalauan hatiku dalam bentuk tulisan-lebih tepatnya ketikan ini.

Sambil sesekali buka hape ngechat sama orang jepang, yang aku heran, kenapa sih aku bisa lancar bahasa inggris kalo chatting, tapi berubah jadi gagu kalo video call. Heran heran heran. Kan keren juga kalo aku bisa ngerocos bahasa inggrisnya kalo lagi skype an sm bule2 bermuka boros tersebut-HAHAHAHAH. :d :D  

Curcol udah, ngatain orang juga udah dikit, sekarang aku mau lanjut me- review makalah princess dulu yaaaaa. 

Pembelajaran Biologi in action

walaupun mata 1,5 watt, tapi aku dan jola-tentunya kuplex dan mbak dewi yg lg pregnant jg turut berkontribusi.. inilah hasil diskas kami today.. semoga bermanfaat

Kompetensi Dasar : Membandingkan mekanisme transport pada membrane ( difusi dan osmosis, transport aktif, endositosis dan eksositosis)

Indikator : Menjelaskan ciri-ciri transport secara difusi dan osmosis.

Pendekatan : Student Centered (Siswa sebagai pusat); dengan harapan siswa mengetahui bagaimana terjadinya proses difusi dan osmosis dengan bantuan perangkat praktikum melalui percobaan, dan guru hanya mengarahkan siswa dalam praktikum.

Strategi Pembelajaran : Melakukan percobaan dengan menggunakan potongan kentang dan pepaya yang dimasukkan ke dalam larutan yang memiliki tingkat konsentrasi berbeda.

MetodePembelajaran : Metode eksperimen. Cara pengelolaan pembelajaran yang melibatkan siswa secara aktif dan mandiri dengan melakukan percobaan difusi dan osmosis.

dak penting

just share:

Kalau cowok ganteng pendiam, cewek-cewek bilang: Woow, cool banget…
Kalau cowok jelek pendiam, cewek-cewek bilang: Ih kuper…
Kalau cowok ganteng jomblo, cewek-cewek bilang: Pasti dia perfeksionis
Kalau cowok jelek jomblo, cewek-cewek bilang: Sudah jelas…kagak laku…
Kalau cowok ganteng berbuat jahat, cewek-cewek bilang: Nobody’s perfect
Kalau cowok jelek berbuat jahat, cewek-cewek bilang: Pantes…ta...mpangnya kriminal
Kalau cowok ganteng nolongin cewe yang diganggu preman, cewek-cewek bilang: Wuih, jantan…kayak di filem-filem
Kalau cowok jelek nolongin cewe yang diganggu preman, cewek-cewek bilang: Pasti premannya temennya dia…
Kalau cowok ganteng dapet cewek cantik, cewek-cewek bilang: Klop….serasi banget…
Kalau cowok jelek dapet cewek cantik, cewek-cewek bilang: Pasti main dukun…
Kalau cowok ganteng diputusin cewek, cewek-cewek bilang: Jangan sedih, khan masih ada aku…
Kalau cowok jelek diputusin cewek, cewek-cewek bilang:…(Terdiam, tapi telunjuknya meliuk-liuk dari atas ke bawah)
Kalau cowok ganteng ngaku indo, cewek-cewek bilang: Emang mirip-mirip bule sih…
Kalau cowok jelek ngaku indo, cewek-cewek bilang: Pasti ibunya Jawa, bapaknya robot…
Kalau cowok ganteng penyayang binatang, cewek-cewek bilang: Perasaannya halus…penuh cinta kasih
Kalau cowok jelek penyayang binatang, cewek-cewek bilang: Sesama keluarga emang harus menyayangi…
Kalau cowok ganteng bawa BMW, cewek-cewek bilang: Matching…keren luar dalem
Kalau cowok jelek bawa BMW, cewek-cewek bilang: Mas, majikannya mana?…
Kalau cowok ganteng males difoto, cewek-cewek bilang: Pasti takut fotonya kesebar-sebar
Kalau cowok jelek males difoto, cewek-cewek bilang: Nggak tega ngeliat hasil cetakannya ya?…
Kalau cowok ganteng naek motor gede, cewek-cewek bilang: Wah, kayak lorenzo lamas…bikin lemas…
Kalau cowok jelek naek motor gede, cewek-cewek bilang: Awas!! mandragade lewat…
Kalau cowok ganteng nuangin air ke gelas cewek, cewek-cewek bilang: Ini baru cowok gentlemen
Kalau cowok jelek nuangin air ke gelas cewek, cewek-cewek bilang: Naluri pembantu emang gitu…
Kalau cowok ganteng bersedih hati, cewek-cewek bilang: Let me be your shoulder to cry on
Kalau cowok jelek bersedih hati, cewek-cewek bilang: Cengeng amat!!!…ini laki-laki apa bukan sih?!

cerita gak mutu

jadii.. hari ini cuma keliling2 di seputeran unsri bukit sama mama.
ban motor pecah..

semua rencana kita berdua kacau..
mau nemenin mama ke salah satu toko baju favorite mama, tapi mama keburu bad mood karena ban motor sialan.
udah pulang aja kak-kata mama.. mama BT..

jadi.. kita batal belanjaaaaa.. dan aku kesel bgt.. #bawa motor 80km/jam, mama teriak2 dibelakang, stop kakak!! mma gak ngajarin kamu buat jadi pembalap.

*cerita gak mutu !!

soal biokim

SOAL

1. Berapa kkal energi yang dihasilkan pada proses katabolisme karbohidrat menjadi CO2 dan H2O, jika dimulai dari :

a. Glukosa

b. Fruktosa 6 fosfat

c. Firuvat

d. Asetil coenzim A

Diketahui 1 ATP = 7,3 kkal

2. Coba anda jelaskan proses terjadinya fotosistem I dan fotosistem II dalam reaksi terang !

3. Kapan terjadi reaksi gelap dalam proses fotosintesis ? Coba anda jelaskan dengan menggunakan siklus kalvin.

4. Tulis struktur nukleosida yang terbentuk dari gabungan basa nitrogen sitosin dengan 3-D-ribosa. Namailah nukleosida itu?

5. Jika gugus fosfat ditambahkan pada gugus 5-hidroksil dari nukleosida pada soal no.4, untuk membentuk nukleotida, bagaimana struktur dan nama dari nukleotida itu?

6. Coba anda jelaskan proses reflikasi, transkripsi, dan translasi pada proses metabolisme informasi/biosintesis protein?

7. Di dalam metabolisme lipid terjadi beta oksidasi. Coba anda jelaskan tahap-tahap yang terjadi dalam reaksi tersebut diatas?

8. Coba anda jelaskan proses terjadinya degradasi lipid yang rantai atom carbonnya ganjil.

9. Coba anda jelaskan bagaimana proses terjadinya

a. Inhibisi kompetitif

b. Inhibisi non-kompetitif

c. Inhibisi in-kompetitif

10. Coba anda jelaskan kenapa orang yang sakit atau demam tidak mempunyai selera makan?

1. Berapa kkal energi yang dihasilkan pada proses katabolisme karbohidrat menjadi CO₂ dan H₂O, jika dimulai dari :

1. Glukosa
2. Fruktosa 6 fosfat
3. Firuvat
4. Asetil coenzim A

Diketahui 1 ATP = 7,3 kkal

Jawaban:

1. a. Dari Glukosa

Glikolisis 2 ATP 2 NADH

Oksidasi piruvat - 2 NADH

Siklus Krebs 2 ATP 6 NADH 2FADH

4 ATP 10NADH 2FADH

Transfor elektron 4ATP 30NADH 4ATP

= 38 ATP

= 38-2 ATP

= 36 ATP x 7,3 kkal = 262, 8 kkal.

b. Fruktosa 6 fosfat

Glikolisis 2 ATP 2NADH

Oksidasi piruvat - 2NADH

Siklus Krebs 2ATP 6NADH 2FADH

5ATP 10NADH 2FADH

Transpor elektron 5ATP 30ATP 4ATP

= 39 ATP

= 39 – 1 ATP

= 38 ATP x 7,3 kkal = 277,4 kkal.

c. Piruvat

Piruvat - 2NADH

Siklus Krebs 2 ATP 6NADH 2FADH

2ATP 8NADH 2FADH

Transfor elektron 2ATP 24NADH 4ATP

= 30ATP – 2ATP

= 28ATP x 7,3 kkal = 204,4 kkal.

d. Asetil ko-A

Siklus Krebs 2ATP 6NADH 2FADH

Transfor elektron 2ATP 18NADH 4ATP

= 24ATP x 7,3 kkal = 175,2 kkal

2. Coba anda jelaskan proses terjadinya fotosistem I dan fotosistem II dalam reaksi terang !

Jawab : Penangkapan energi cahaya (fotosistem)

Fotosistem merupakan tahap pertama dari proses fotosintesis. Ketika klorofil menyerap energi foton dari cahaya, elekton dari klorofil akan terlepas ke orbit luar (tereksitasi). Ada 2 macam fotosistem di dalam tilakoid yaitu :

1. fotosistem I

Didalam fotosistem I terdapat molekul klorofil yang berada pada pusat reaksi dari fotosistem I dinamakan P700. Disebut demikian karena sangat baik menyerap energi cahaya dengan panjang gelombang 700 nm.

2. fotosistem II

Didalam fotosistem II terdapat molekul klorofil yang berada pada pusat reaksi fotosistem II dan dinamakan P680. Disebut demikian karena sangat baik menyerap energi cahaya dengan panjang gelombang 680 nm

3. Reaksi gelap (siklus kalvin)

6CO₂

12 fosfogliserat

6 RUBP/RUDP 12 PGAL

Siklus

Kalvin

3 PGAL

5 dihidroksida

asetonfosfat

glukosa

3 DHAP

.

4.

5.

6.REPLIKASI DNA
Replikasi DNA berarti penggandaan. Ada 3 model replikasi DNA yaitu :

Model konservatif.

Model ini menyatakan bahwa 2 rantai DNA bereplikasi tanpa memisahkan rantai-rantainya.

Model semi konservatif.

Model ini menyatakan bahwa 2 rantai DNA berpisah kemudian bereplikasi.

Model dispersi.

Model ini menyatakan bahwa DNA terpecah menjadi potongan-potongan yang kemudian bereplikasi.

Meselson dan Stahl membuktikan bahwa DNA bereplikasi sesuai model semi-konservatif.
Proses replikasi terbagi atas 3 tahap:

Inisiasi. Replikasi tidak berlangsung pada titik acak pada DNA namun berlangsung pada awal yang disebut tempat awal replikasi. Protein inisiator menempel pada daerah tersebut kemudian berikatan menyebatkan rantai heliks terbuka untuk menunjukkan satu rantai yang digunakan untuk membangun rantai baru.

Elongasi. DNA polimerase bertugas untuk memasangkan basa nitrogen baru dengan rantai DNA lama sehingga terbentuklah rantai DNA yang baru. DNA polymerase menambahkan basa-basa baru ke ujung 3 rantai yang ada, kemudian mereka mensintesis dari arah 5’ ke 3’ dengan menyediakan rantai basa pasangan untuk cetakan. Triplet AUG merupakan sinyal untuk memulai proses sintesis, sehingga triplet ini dinamakan kodon start.

Terminasi. Replikasi berakhir saat DNA polimerase mengenali daerah basa nitrogen yang diulang-ulang, daerah ini disebut telomer.Maka terbentuklah rantai DNA yang baru.

Pada Sintesis protein, salah satu rantai DNA akan dikodekan oleh mRNA. Rantai yang dikodekan tersebut disebut DNA Sense atau DNA template, sedangkan rantai pasangannya yang tidak dicetak disebut DNA Antisense atau DNA Komplementer. Triplet kode-kode genetik DNA yang dikodekan oleh mRNA disebut kodogen.

Transkripsi.

DNA membuka menjadi 2 rantai terpisah. Karena mRNA berantai tunggal, maka salah satu rantai DNA ditranskripsi (dicopy). Rantai yang ditranskripsi dinamakan DNA sense atau template dan kode genetik yang dikode disebut kodogen. Sedangkan yang tidak ditranskripsi disebut DNA antisense/komplementer. RNA Polimerase membuka pilinan rantai DNA dan memasukkan nukleotida-nukleotida untuk berpasangan dengan DNA sense sehingga terbentuklah rantai mRNA. Contoh transkripsi:

Translasi

mRNA / RNAd yang sudah terbentuk keluar dari anak inti sel menuju rRNA. Disana mRNA masuk ke rRNA / RNAr diikuti oleh tRNA / RNAt. Ketika antikodon pada tRNA cocok dengan kodon mRNA kemudian rantai bergeser ke tengah. Kodon mRNA berikutnya dicocokkan dengan tRNA kemudian asam amino yang pertama berikatan dengan asam amino kedua. tRNA pertama keluar dari rRNA. Proses ini berlangsung hingga kodon stop, ribosom subunit besar dan kecil terpisah, mRNA dan tRNA keluar dari ribosom.

Kodon stop : UAA,UAG, UGA

Rumus cepat:mRNA=DNA komplementer=DNA antisense=kode protein
tRNA=DNA template=DNA sense=kodogen. Berikut ini adalah gambar proses sintesis protein.

Kesalahan transkripsi oleh RNAt dapat menimbulkan kesalahan pembentukan protein.

Pada proses transkripsi urutan kode genetic dari DNA dibawa oleh RNAt ke ribosom tempat terjadinya pembentukan asam amino yang termasuk kodon stop adalah UAA, UAG, DAN UGA, sedangkan kodon start adalah AUG.

Di antara sel – sel manusia berikut ini, yang tidak mempunyai kromosom homolog adalah

Sintesis protein pada sel prokariotik berbeda dengan sel eukariotik.

Pada sintesis protein sel prokariotik semua kode genetic akan ditranskripsi dan ditranslasi, sedangkan pada sel eukariotik tidak.

7. β oksidasi terdiri dari 4 proses utama: Dehidrogenasi, Hidratasi, Dehidrogenasi,Thiolisis

Step 1 : Dehidrogenasi / Oksidasi

Berperan pada pembentukan rantai ganda antara atom C2 – C3.

Mempunyai akseptor hidrogen FAD+.

Antara asam lemak yg berbeda panjangnya àbeda enzimnya,

Step2 : Hidratasi

Mengkatalisis hidrasi trans enoyl CoA

Penambahan gugus hidroksi pada C no. 3

Ensim bersifat stereospesifik

Menghasilkan 3-L-hidroksiasil Co. A

Step 3 : Dehidrogenasi

Mengkatalisis oksidasi -OH pada C no. 3 / C β à menjadi keton

Akseptor elektronnya : NAD⁺

Step 4 : Thiolisis

β-Ketothiolase à mengkatalisis pemecahan ikatan thioester.

Acetyl-CoA à dilepas dan tersisa asam lemak asil ko A yang terhubung dengan thio sistein mll ikatan tioester.

Tiol HSCoA menggantikan cysteine thiol, menghasilkan fatty acyl-CoA (yang telah berkurang 2 C).

8 Degradasi lipid yang rantai atom karbonnya ganjil, contohnya degradasi pada asam lemak tak jenuh..

Degradasi asam lemak tak jenuh

Membutuhkan 2 ensim tambahan yaitu:

Enoyl CoA isomerase

2,4 dienoyl CoA reduktase

Degradasi FA dengan jumlah C ganjil à pada akhir beta oksidasi à acetoacetil Co A à dipecah akan menghasilkan propionil Co A dan Asetil Co A

Propionil Co A à diubah menjadi metilmalonil Co A à suksinil Co.A à TCA

Asam lemak merupakan bentuk simpanan energi metabolik yang paling efisien.

TAG terdiri dari 3 asam lemak dan gliserol

TAG didegradasi oleh enzim lipase di dalam usus halus menjadi asam lemak dan gliserol.

Asam lemak melewati dinding usus halus, dan TAG kembali disintesis dan ditransport di dalam darah oleh chylomicrons.

Chylomicrons terikat pada sel lemak (adipocytes) dan TAG didegradasi lagi menjadi asam lemak dan gliserol

Asam lemak masuk sel adiposa kmdn disintesis kembali mjd TAG dan disimpan.

TAG di dalam adiposa didegradasi menjadi asam lemak sebagai respon terhadap sinyal hormon. Asam lemak bergabung dengan Co A terlebih dahulu sebelum didegradasi.

Degradasi asam lemak menjadi asetil Co A terjadi dalam matriks mitokondria.

Karnitine membawa asam lemak rantai panjang ke dalam mitokondria untuk didegradasi.

9.Proses terjadinya macam-macam inhibisi pada enzim.

a. Inhibisi kompetitif

Pada inihibisi kompetitif, inhibitor dan substrat berkompetisi untuk berikatan dengan enzim. Seringkali inhibitor kompetitif memiliki struktur yang sangat mirip dengan substrat asli enzim. Sebagai contoh, metotreksat adalah inihibitor kompetitif untuk enzim dihidrofolat reduktase. Pengikatan inhibitor tidaklah perlu terjadi pada tapak pengikatan substrat apabila pengikatan inihibitor mengubah konformasi enzim, sehingga menghalangi pengikatan substrat. Pada inhibisi kompetitif, kelajuan maksimal reaksi tidak berubah, namun memerlukan konsentrasi substrat yang lebih tinggi untuk mencapai kelajuan maksimal tersebut, sehingga meningkatkan K_m.

b. Inhibisi tak kompetitif (incompetitif)

Pada inhibisi tak kompetitif, inhibitor tidak dapat berikatan dengan enzim bebas, namun hanya dapat dengan komples ES. Kompleks EIS yang terbentuk kemudian menjadi tidak aktif. Jenis inhibisi ini sangat jarang, namun dapat terjadi pada enzim-enzim multimerik. Terjadi ketika inhibitor enzim hanya mengikat bentuk kompleks antara enzim dan substrat.

c. Inhibisi non-kompetitif

Inhibitor non-kompetitif dapat mengikat enzim pada saat yang sama substrat berikatan dengan enzim. Baik kompleks EI dan EIS tidak aktif. Karena inhibitor tidak dapat dilawan dengan peningkatan konsentrasi substrat, V_max reaksi berubah. Namun, karena substrat masih dapat mengikat enzim, K_m tetaplah sama. Inhibitor yang melekat pada sisi lain selain situs aktif pada enzim. Lama kelamaan mengubah sisi aktif enzim.

10. Coba anda jelaskan kenapa orang yang sakit atau demam tidak mempunyai selera makan?

Jawab : Peradangan usus (peptic uker) dan food intolerence menyebabkan orang mengalami stres, depresi atau shock, demam dan alergi saluran selaput lendir/rhinitis juga dapat menurunkan nafsu makan karena berkurangnya daya perasa dan penciuman. Faktor lain yang dapat menburunkan nafsu makan yakni konsumsi obat-obatan tertentu dan perubahan hormonal akibat fisik dan hormon tubuh. Disisi lain hilangnya nafsu makan bisa disebabkan kurangnya asupan gizi tertentu. Misalnya kekurangan zink bisa menurunkan indera perasa dan penciuman. Demikian juga kekurangan kalsium dan magnesium.